显微镜的使用一般步骤：
一、取镜
1. 右手握住镜臂，左手托住镜底（若使用者为左撇子，则相反。下同）
2. 把显微镜放在试验台上，略偏左（显微镜放在距试验台边缘7厘米左右处。）安装好目镜和物镜。
二、对光
3. 转动转换器，使低倍物镜对准通光孔（物镜的前段与载物台要保持2厘米的距离）。
4. 把一个较大的光圈对准通光孔。左眼注视目镜内（右眼睁开，同时画图）。转动反光镜，使光线通过通光孔反射到镜筒内。通过目镜，可以看到白亮的视野。
三、观察
5. 观察。将切片或装片放在载物台上，标本正对通光孔中心。转动粗准焦螺旋（顺时针），俯首侧视镜筒慢慢下降，之二到物镜接近切片（约0.5cm），左眼观察目镜，（反时针）旋转粗准焦螺旋，使物镜筒慢慢上升，看到物像时轻微来回旋转细准焦，直到物像清晰。观察时两眼都要睁开，便于左眼观察，右眼看着画面。侧面观察降镜筒→左眼观察找物像→细准焦螺旋调清晰。
6. 装片的制作和移动：制作：滴清水→放材料→盖片。移动：物象偏在何方，就将载玻片向何处移动。
7. 高倍镜的转换，找到物像后，把要观察的物像移到视野中央，把低倍镜移走，换上高倍镜，只准用细准焦螺旋和反光镜把视野调理清晰，知道物像清楚为止。顺序：移装片→转动镜头转换器→调反光镜和光圈→调细准焦螺旋。
8. 完毕工作。使用完毕后，取下装片，转动镜头转换器，逆时针旋出物镜。旋进镜头盒；取出目镜，插进镜头盒，盖上。把显微镜放正。注：换高倍物镜时只能移动转换器，换镜后，只准调节细准焦和反光镜（或光圈）。
注意事项：实验完毕，把显微镜的外表擦拭干净。转动转换器，把两个物镜偏到两旁，并将镜筒缓缓下降到较低处。较好把显微镜放进物箱里，放回原处。
